6 月 9 日，由全球基因測序與芯片龍頭企業(yè)之一的因美納與 DeepTech 聯(lián)合主辦的“2023‘博思納新’多組學賦能藥物開發(fā)”主題活動圓滿收官。因美納、英矽智能、迦進生物、成都先導、普瑞基準等行業(yè)上下游知名公司的多位代表齊聚線上，就 NGS（新一代測序技術(shù)）和多組學研究如何賦能藥物研發(fā)進行了精彩的分享和熱烈的討論。
活動在 DeepTech 高級總監(jiān)張昊主持下拉開帷幕。因美納科研應(yīng)用市場副總監(jiān)胡翔華在致辭中表示隨著基因測序技術(shù)的進步與迭代，NGS 的使用場景不斷外拓。而在 NGS 的加持下，多組學研究也在藥物研發(fā)過程中發(fā)揮出更多更重要的作用，為行業(yè)帶來了更多的活力。
圖丨因美納科研應(yīng)用市場副總監(jiān)胡翔華
因美納資深應(yīng)用市場經(jīng)理彭闈硯對多組學研究、藥物開發(fā)所遇的挑戰(zhàn)以及如何利用多組學研究為藥物開發(fā)賦能進行了充分的講解。“十年時間、十億美元”的“雙十定律”一直是藥物開發(fā)面臨的困境，而多組學研究正在試圖打破這個困境。彭闈硯通過一些國外案例生動地為大家展示了多組學研究在藥物研發(fā)中的應(yīng)用。同樣，作為基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組等數(shù)據(jù)信息的重要獲取工具，因美納的 NGS 測序儀在多組學研究中已變得不可或缺。“利用好 NGS 這樣的工具，可以更好地推動藥物開發(fā)。”彭闈硯說。
圖丨因美納資深應(yīng)用市場經(jīng)理彭闈硯
英矽智能生物信息學負責人陳珊詳細地為大家介紹了生成式人工智能（AI）和自動化實驗室如何在藥物新靶點的發(fā)現(xiàn)及藥物研發(fā)中發(fā)揮作用。在生成式 AI 方面，英矽智能通過三大平臺來輔助實現(xiàn)發(fā)現(xiàn)新靶點和產(chǎn)生新的化合物。PandaOmics 平臺作為基因和藥物/疾病相關(guān)性的底層平臺，可評估新靶點和疾病的關(guān)系，以肉瘤距離，通過 ChatPandaGPT 和知識圖譜可獲得與疾病相關(guān)的靶點、靶點成藥性及發(fā)病機制的生物學過程等重要信息；Chemistry 42 平臺可從頭開始生成具有所需特性的小分子；inClinico 平臺可評估在研項目從臨床 II 期轉(zhuǎn)換到 III 期的成功率。另一方面，英矽智能開創(chuàng)性地將人工智能平臺和自動化實驗室相結(jié)合，通過人工智能比較組學 Omics 數(shù)據(jù)，下達自動化實驗的決策，完成大規(guī)模的基因組學/化學微擾和多個測序工作流，并提供全流程信息存儲和多格式管理。
圖丨英矽智能生物信息學負責人陳珊
迦進生物聯(lián)合創(chuàng)始人兼 COO 張雪峰為大家解讀了同樣十分前沿的小核酸偶聯(lián)藥物設(shè)計。近年來，“小核酸藥物”、“抗體偶聯(lián)藥物”都是生物醫(yī)藥領(lǐng)域討論的熱詞，而這兩個詞碰撞在一起又會擦出怎樣的火花？據(jù)張雪峰介紹，迦進生物專注于小核酸偶聯(lián)藥物，是國內(nèi)首批通過生物偶聯(lián)實現(xiàn)核酸藥物的肝外遞送，以治療肌肉及中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病的公司。迦進生物擁有的技術(shù)平臺包括 siRNA 發(fā)現(xiàn) & 修飾、抗體 & 多肽的發(fā)現(xiàn)和改造、親和力及表位確認、偶聯(lián)技術(shù)、專屬細胞系以及疾病動物模型。
圖 丨迦進生物聯(lián)合創(chuàng)始人兼 COO 張雪峰
成都先導研發(fā)化學中心副總裁劉觀賽則與大家分享了 DNA 編碼化合物庫技術(shù)的應(yīng)用。劉觀賽首先介紹了 DNA 編碼化合物庫技術(shù)：通過共價連接的關(guān)聯(lián)團將小分子與 DNA 編碼部分相連接，從而為每一個分子賦予一個獨特的 DNA 標簽。該技術(shù)與傳統(tǒng)高通量篩選辦法相比，具有時間短、效率極高和成本低廉等特點。通過 DNA 編碼庫可以進行靶點的多樣性分子篩選，也可以實現(xiàn)聚焦分子庫的設(shè)計、分子的優(yōu)化等。截止目前，成都先導已經(jīng)擁有約 1.2 萬億 DNA 編碼的分子，其中 95% 屬于多樣性小分子化合物。
圖丨成都先導研發(fā)化學中心副總裁劉觀賽
普瑞基準創(chuàng)始人兼 CEO 季序我在《多組學數(shù)據(jù)挖掘，助力創(chuàng)新藥物研發(fā)：趨勢與實踐》主題演講中展示了多組學數(shù)據(jù)挖掘在新藥研發(fā)中的重要作用。普瑞基準自主研發(fā)的 AI 驅(qū)動的功能組學數(shù)據(jù)產(chǎn)生及挖掘系統(tǒng) AIBERT，聚焦藥物研發(fā)的核心問題：靶標發(fā)現(xiàn)及評估、生物標志物鑒定、適應(yīng)癥評估和藥物聯(lián)用策略。季序我博士結(jié)合具體案例，展示了 AIBERT 如何解決藥企關(guān)心的上述問題。“這個系統(tǒng)提供了一個與傳統(tǒng)實驗相對來說獨立的評估角度；將它與實驗相結(jié)合，通過實驗和計算結(jié)果之間的反復迭代，可以快速得到答案，壓縮嘗試空間，從而節(jié)省大量的人力、時間和資金，并有效提高研發(fā)效率。”季序我總結(jié)道。
圖丨普瑞基準創(chuàng)始人兼 CEO 季序我
在由因美納大中華區(qū)藥企業(yè)務(wù)總監(jiān)張金鐳主持的“基于 NGS 的多組學驅(qū)動新藥研發(fā)”圓桌討論中，劉觀賽、陳珊、張雪峰及季序我四位嘉賓基于各自的業(yè)務(wù)，就 NGS 與多組學在研發(fā)過程中的創(chuàng)新性應(yīng)用和面臨的挑戰(zhàn)進行了分享糖心vlog在線觀看。
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圖丨“基于 NGS 的多組學驅(qū)動新藥研發(fā)”圓桌
在劉觀賽看來，DNA 編碼化合物庫技術(shù)可以快速有效地識別出與特定靶點相互作用的小分子，從而提高藥物研發(fā)的效率。高效工具的使用會產(chǎn)生海量數(shù)據(jù)，不過海量數(shù)據(jù)的處理與解讀亦是一項新挑戰(zhàn)。陳珊則表示，利用多組學數(shù)據(jù)可以發(fā)現(xiàn)基因表達與疾病的關(guān)系，從而加速新靶點的發(fā)現(xiàn)，開發(fā)新療法。不過，獲得多組學數(shù)據(jù)后如何與其他數(shù)據(jù)做更好的結(jié)合是需要進一步思考的問題。張雪峰說：“小核酸藥物特別適合治療有明確靶基因及需要長期用藥的遺傳病與慢病。而 NGS 可以幫助揭示更多疾病機理與致病基因，讓我們找到更多更好的靶點。在現(xiàn)實應(yīng)用場景中，當利用 NGS 做小核酸藥物脫靶分析時，結(jié)果的處理和解讀是正在面臨的挑戰(zhàn)。”季序我則認為，NGS 作為目前來說最成熟的組學研究工具，在加深研究人員對疾病生物學理解上有著不可替代的作用。做好多組學數(shù)據(jù)整合和挖掘，讓它成為新藥研發(fā)的高效工具，既是機遇也是挑戰(zhàn)，普瑞基準作為國內(nèi)該方向的開拓者，已經(jīng)構(gòu)筑了系統(tǒng)能力，并在具體項目上獲得了初步成功。普瑞基準愿意與更多新藥研發(fā)者分享經(jīng)驗，推動該領(lǐng)域的發(fā)展糖心vlog入口。
最后，張金鐳總結(jié)道：“NGS 是一個非常有用的底層工具，在藥物研發(fā)不同環(huán)節(jié)都貢獻了自己的力量。當然，新生事物從誕生起就會有挑戰(zhàn)。我們也希望能攜手行業(yè)上中下游的伙伴們共同克服挑戰(zhàn)，讓這個領(lǐng)域更加枝繁葉茂。”
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